উপাচার্য নিয়োগ নিয়ে পশ্চিমবঙ্গ সরকার ও রাজ্যপাল তথা আচার্য্য সি ভি আনন্দ বোসের মধ্যে চলতে থাকা বিরোধের প্রেক্ষিতে, সুপ্রিম কোর্ট উপাচার্য নিয়োগে পৃথক অথবা যৌথ সার্চ কমিটি গড়ার নির্দেশ দিয়েছে। প্রাক্তন প্রধান বিচারপতি ইউ ইউ ললিতের নেতৃত্বে এই কমিটি দু সপ্তাহের মধ্যে গঠন করতে হবে। প্রত্যেক উপাচার্যের ক্ষেত্রে বাছাই কমিটির সভাপতিত্ব করবেন প্রাক্তন প্রধান বিচারপতি। পাঁচ জন সদস্যকে নিয়ে সার্চ কমিটি গঠন করতে হবে। তারা প্রত্যেক বিশ্ববিদ্যালয়ের উপাচার্য পদের জন্য তিনটি নামের প্যানেল প্রস্তুত করবেন। কমিটির প্রধান অনুমোদন করার পর রাজ্যের মুখ্যমন্ত্রীর কাছে সেই তালিকা পেশ করতে হবে। মুখ্যমন্ত্রী যদি কোনো ব্যক্তিকে অযোগ্য বলে মনে করেন, তাহলে তাঁর মতামত এবং সেই মতামতের সমর্থনে নথি দু’সপ্তাহের মধ্যে পেশ করতে হবে আচার্যের কাছে।