আর জি কর কাণ্ডে নিজেদের রিপোর্ট প্রকাশ করেছে জাতীয় মহিলা কমিশন। এই রিপোর্টে হাসপাতালে নিরাপত্তা, পরিকাঠামো এবং মামলার তদন্তে ত্রুটির উল্লেখ করা হয়েছে। হাসপাতালের মহিলা চিকিৎসক, নার্সদের জন্য অপর্যাপ্ত সুবিধা এবং নিরাপত্তার অভাবের কথাও বলা হয়েছে। মহিলা কমিশনের রিপোর্টে হাসপাতালে অপর্যাপ্ত শৌচাগারের কথা বলা হয়েছে। অপর্যাপ্ত আলো এবং নিরাপত্তা ব্যবস্থায় যথেষ্ট অভাবের কথাও উল্লেখ করা হয়েছে। শুধু তাই নয়, আর জি করের প্রাক্তন অধ্যক্ষ সন্দীপ ঘোষকে জিজ্ঞাসাবাদের প্রক্রিয়া অসম্পূর্ণ ছিল বলে ওই রিপোর্টে জানানো হয়েছে। জাতীয় মহিলা কমিশনের কমিটি আর জি কর কান্ডের পুঙ্খানুপুঙ্খ ও দ্রুত তদন্তের আহ্বান জানিয়েছে ।
একইসঙ্গে মহিলা কমিশনের রিপোর্টে অভিযোগ করা হয়েছে, যে সেমিনার হলে ধর্ষণ ও খুনের ঘটনা ঘটেছিল, তার উল্টো দিকের ঘরে হঠাৎ করেই সংস্কারের কাজ শুরু হয়। এই বিষয়টিকে প্রমাণ লোপাটের সম্ভাব্য চেষ্টায় যুক্ত বলে দাবি করা হয়েছে।